支付乙公司运费的会计分录如何处理？

在企业日常经营中，支付乙公司运费的会计处理需结合业务场景、责任归属和税务关系综合判断。不同情境下，会计科目选择和增值税处理存在显著差异，核心要点包括代垫运费的往来核算、费用归属的科目定位以及进项税额的合规抵扣。以下分场景解析具体操作流程。

若乙公司是运输服务提供方且运费由甲公司承担，需区分发票开具方式。当运输方直接向甲公司开具发票时，会计分录为：
借：销售费用—运费
借：应交税费—应交增值税(进项税额)
贷：银行存款
此处销售费用用于销售商品相关的运费，进项税额需确保与应税项目相关且取得合规增值税专用发票。若运费用于免税项目或集体福利，则不得抵扣进项税。

当甲公司为乙公司代垫运费时，需通过往来科目过渡。例如乙公司委托甲公司代付运费且发票开给乙公司，甲公司支付时：
借：其他应收款—乙公司
贷：银行存款
待乙公司归还代垫款项时反向冲销。若发票误开给甲公司，需特别注意：根据税法规定，代垫运费属于价外费用，需按比例计提销项税额。此时需先红冲原分录，再补充增值税处理：

1. 支付时代垫：
   借：应收账款—乙公司
   贷：银行存款
2. 确认价外费用：
   借：销售费用
   贷：应交税费—应交增值税(销项税额)

对于采购环节发生的运费，若乙公司为供应商且运费计入存货成本，会计分录为：
借：原材料/库存商品（含运费）
借：应交税费—应交增值税(进项税额)
贷：应付账款—乙公司
此处需将运费并入存货采购成本，遵循实际成本法原则，且确保运输服务与采购活动直接相关。

特殊情况下，若乙公司是客户且运费由其承担，但由甲公司先行支付，需通过应收科目核算。例如销售商品时约定运费由乙公司负担：

1. 代垫运费时：
   借：应收账款—乙公司
   贷：银行存款
2. 收回款项时：
   借：银行存款
   贷：应收账款—乙公司
   若运输发票由第三方开具给乙公司，甲公司仅作为代付方，则无需确认进项税额。

实务操作中需重点关注两点：一是权责发生制要求，运费需在服务完成时确认而非支付时点；二是票据合规性，增值税专用发票的抬头与用途必须匹配应税项目。任何偏离业务实质的会计处理均可能引发税务风险。